聖誕節臨近，獅子亞歷克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、斑馬馬蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、長頸鹿邁爾曼（大衛·休默 David Schwimmer 配音）以及河馬格洛里亞（賈達·萍克·史密斯 Jada Pinkett Smith 配音）決定正式告別馬達加斯加，回到久違的紐約共度佳節。冷冷清清的送別晚會沒能熄滅它們歸去的熱情，好夥伴們燃起熱氣球正式出發，可是卻被狐猴王朱利安當作紅色妖盜擊落下來。不久，真的紅色妖盜出現夜空，混亂之中亞歷克斯陰差陽錯將其打落，結果卻發現所謂的紅
