萌騎士團與闍黑大戰之後的半年，隕石突然飛向萌學園，彗星小組卻察覺萌騎士隊長艾瑞克竟隨著隕石掉落到萌學園！大甜甜教員立刻展開治療駛卷使微弱的艾瑞克，並聯絡夸特諾基地的陶格長老幫忙。相同，謎亞星卻掉落在地

《科學偵探團》由萌學園中的萌騎士：智之星-謎亞星、月之星-潼恩、炎之星-焰王，以及魔法新生KIKI四人主持。