遙遠的未來，地球一度變成冰凍星球。倖存的人類移民外太空，建立了繁榮的殖民星球阿瓦隆，並與外星人成立人類銀河聯盟。與此同時，名為希迪爾斯的異形肆虐繁殖，與聯盟展開曠日持久的戰爭。在一次針對希迪爾斯母星的戰役中，年僅16歲的少尉雷德（石川界人 配音）所在部隊遭遇猛烈抵抗。撤退途中，雷德不慎被捲入時空裂縫，與他所駕駛的殲滅兵器錢伯墜落在地球的汪洋中。錢伯被人類打撈到加爾剛蒂亞艦團之上，面對這個與印象中完全不同的人類發源之星，雷德不知所措。在此期間，他和可愛的少女艾米（金元壽子 配音）溝通交流，併成功幫助他們挫敗

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《迷你加爾剛蒂亞》是動畫《翠星之加爾剛蒂亞》官方網站提供的短片，於每新一集翠星放映後更新。 “推測頭身縮小70%，可愛度比本篇增加900%以上，是為了補足本篇的人物和情報，順便拿角色來隨便玩玩！”而製