主要講述了與妹妹一起生活、就讀於都立來禪高中的主人公五河士道，過著平常的生活的他在四月十日遇上了一場大爆炸，而在大爆炸之中出現了被稱作精靈的謎之美少女夜刀神十香。精靈是存在於鄰界的特殊災害指定生命體，