故事發生在遙遠的未來，肆虐的異生獸給人類的安全帶來了巨大的困擾，為了抵擋異獸的進攻，日本政府成立了防衛組織TLT，其中，夜襲隊擁有著最強大的實力和最強勁的武器，是整個組織內部的中堅力量。 然而，面對經過了進化的新型異生獸，夜襲隊亦束手無策，在這個節骨眼上，光之巨人奈克瑟斯奧特曼和它的適能者姫矢準（桐島優介 飾）出現了。在奈克瑟斯奧特曼創造出的美塔領域中，奧特曼和異獸之間展開了激烈的鬥爭。孤門一輝（川久保拓司 飾）是TLT裡的新進成員，當他目睹了奈克瑟斯奧特曼強大的力量後，開始對奧特曼的起源和姬矢準的神秘過

正在調查墜落在太平洋上的不明飛行物體的海上自衛隊二尉有動貴文（大澄賢也），遇到了突然出現的藍光，受發光體的影響，導致遺傳因子標準的變質，變成了兇惡的怪獸THEONE。之後，他（THEONE）從防衛廳內

　　正在調查墜落在太平洋上的不明飛行物體的海上自衛隊二尉有動貴文（大澄賢也），遇到了突然出現的藍光，受發光體的影響，導致遺傳因子標準的變質，變成了兇惡的怪獸THE ONE。之後，他（THE ONE）從